凍干制品的生產過程中，經常會出現一些常見問題，出現的常見問題又是如何解決呢？如溶劑回流問題采用有機復合溶劑的凍干制品，有機溶劑在蒸發過程中會損失相當一部分。若使用高揮發性的溶劑如叔丁醇，則揮發的叔丁醇會集中在管型瓶的頂部形成回到溶劑的溶劑流。溶劑流會導致溶液中的藥物分散，凍干結束后，在管型瓶頸會有藥物粉末，從而影響產品的外觀和膠塞及封口密合性。出現這種情況可通過縮短灌裝與冷凍藥液的時間間隔解決次問題。如部分回溶是凍干過程中產生的制品缺陷，在一批外表看似合格的凍干制品中有好多產品的底部存在著孔狀大小的回溶區域或者變色區域，可能因素：1.凍干機的板層或者不同板層之間有較大的溫差；2.盛放樣品的西林瓶的實際熱傳導系數遠低于它的平均值，從而導致西林瓶沒有得到足夠能量去*完成升華干燥，進入解析干燥階段，西林瓶底部仍有極少未完成主干燥的冰塊便熔化。有效方法是延長主干燥過程的時間，但需要控制整個主干燥的工藝過程，延長的時間需根據實驗確定。

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